病毒性心肌炎的发病关键乃正气不足、邪毒侵心。正气不足为发病之本，本病的病位在心，为本虚标实证。《黄帝内经》云：“邪之所凑，其气必虚”，“脉痹不已，复感外邪，内舍于心”，说明机体正气不足、邪毒内侵是发病的诱导因素。中医认为外感温热邪毒，侵及肺卫为发病之标，另外本病总属本虚标实，主要病机为邪毒侵心、耗气伤阴。
急性期：治疗以祛邪为原则，正气不足，不易驱邪外出，导致毒邪留恋，若用扶正之品，易造成闭门留寇之弊。表现为汗出、口渴、咽红肿痛、肌肉酸痛等，热毒侵心、耗气伤阴是急性期的关键，故治疗以清热解毒、祛除外邪为主，同时祛邪勿伤正，兼顾滋养心阴。中药多选用银翘散加减，用金银花、连翘、板蓝根、大青叶清热解毒，牛蒡子、玄参清热利咽。
慢性期：益气养阴为主，勿过滋补恋邪。急性期高热后，壮火食气更耗气阴，迁延日久，正虚邪恋。表现为心悸、气短、盗汗少寐、咽干口渴、舌淡红、苔黄、脉细。此期病机为阴虚内热、心神失守，以气阴两虚为主。须扶助正气、补心气、养阴血，以达到祛邪扶正的目的。中医多选用炙甘草汤加减，嘱恢复期用药不宜过于苦寒，以免耗气伤阴。
